نرم افزار تخصصی شناسایی و دسته بندی کروموزوم های حیوانی با استفاده از آنالیز تصویری Image Chromosome Processing CIP:
بدست آوردن مشخصات کاریوتایپی کروموزوم ها که به دست متخصصان علم ژنتیک و زیست شناسی انجام می شود کاری است وقت گیر. در همین راستا محققان تلاش کردند تا سیستم هایی را به وجود آورند که این امر را تسریع ببخشند.استفاده از علم پردازش تصویر به عنوان یک علم نوپا یک راه حل خوب به نظر می رسد که در سال های اخیر مقالاتی در رابطه با پردازش تصاویر کروموزوم ها منتشر شده است.
اکثر مقالات و سیستم های موجود مربوط به پردازش کروموزوم های انسان است ، و تحقیق چندانی در رابطه با کروموزوم های جانوری به عمل نیامده است.
سیستمی که در پیش رو داریم مربوط به پردازش کورموزو م های جانوری (حدود ۸۵ گونه مختلف ) می باشد.
دانلود نرم افزار CIP Trial | |
دانلود فایل آموزشی | |
دانلود کلیپ آموزشی |
در این محصول کاربر متخصص به کمک نرم افزار قادر خواهد بود تا بسیار سریع به نتایج مطلوب دست یابد.
نرم افزار CIP با اندازه گیری و جداسازی کروموزم ها از یکدیگر به روش های دستی و اتوماتیک امکان شناسایی کروموزوم های جفت و قراردادن آنها درکنار هم دارا می باشند.
اندازه گیری های کاریوتایپی شامل محاسبه طول هر کرومو.م، تعداد بازوها، طول هر باز ، و شناسایی سانترومر، نوع کروموزوم و در نهایت تشخیص جنس کروموزم های جانوری را دارا می باشد.
به کمک این محصول و شناسایی کروموزم ها و تشخیص جنسیت جانور امکان طبقه بندی و دسته بندی جانوران در رسته های مشخص امکان پذیر خواهد بود.
این محصول قابلیت اتصال به میکروسکوپ و یا سیستم های تصویر برداری را دارا بوده که ضمن انجام این مهم به صورت اتوماتیک قابلیت افزایش کیفیت تصاویر را دارا می باشد.
این نرم افزار تمام الگوریتم های پردازش تصویر پیاده سازی شده است.این نرم افزار در محیط های Windows Xp,Vistat قابل اجرا می باشد.
فرآیند بدست آوردن مشخصات کاریوتایپی:
۱٫ بدست آوردن مساحت کروموزوم ها
۲٫ بدست آوردن طول کروموزوم ها
۳٫ بدست آوردن نقطه Centromer
۴٫ بدست آوردن طول بازوی بالایی و بازوی پایینی
۵٫ بدست آوردن نوع هر کروموزوم
۶٫ دسته بندی و مرتب کردن جفت کروموزوم ها
نرم افزار CIP تمام این مشخصات را به صورت خودکار بدست آورده و این امکان را به کاربر می دهدکه نقطه Centromer ،نوع و جفت کروموزوم را تغییر دهد.
این بسته تخصصی با توجه به اعلام نیاز و سفارش گروه پژوهشی جونده شناسی، تهیه و تدوین گردیده است.
طبق امکان سنجی به عمل آمده امکان ارتقاء سیستم آنالیز تصویری برای نمونه های انسانی نیز وجود دارد که بی شک مورد استفاده بسیاری از پژوهشگران علوم پزشکی و ژنتیک خواهد بود. در حوزه علوم پزشکی اقدامات چندان مؤثر و جدی در خارج از کشور و نرم افزارهای مشابه صورت نگرفته و در نتیجه فضای بسیار مناسبی جهت کاربردی کردن سیستم های آنالیز تصویری در این بخش به چشم می خورد.
ویژگی های این نرم افزار به شرح ذیل می باشد:
تشخیص و دسته بندی کروموزوم ها
طبقه بندی کروموزوم ها به انواع مختلف
محاسبه پارامترهای کمی کروموزوم
مشخص کردن نوع جوند و دسته آن
ارتباط با بانک داده و تشخیص جانور
این برنامه در محیط VB نوشته شده است.